Η γενική λειτουργία του 1ου ΕΚ Μυτιλήνης, όπως και των υπόλοιπων ΕΚ της Χώρας, καθορίζεται από τις διατάξεις της Απόφασης αριθμ. 96004/Δ4/17.6.2015 (ΦΕΚ 1318/τ.Β’/1-7-2015) του Αναπληρωτή Υπουργού ΥΠΟΠΑΙΘ, όπως τροποποιήθηκαν από τις Αποφάσεις:
- αριθμ. 133384/Δ4/12.8.2016 (ΦΕΚ 2628/τ.Β’/24.08.2016) του Υπουργού ΥΠΠΕΘ,
- αριθμ. Φ24α/141494/Δ4/28.8.2017 (ΦΕΚ 2994/τ.Β’/31.08.2017) του Υφυπουργού ΥΠΠΕΘ και
- αριθμ. Φ24α/104878/Δ4/28.6.2019 (ΦΕΚ 2759/τ.Β’/03.07.2019) της Υφυπουργού ΥΠΠΕΘ.
και το άρθρο 101 του νόμου 4763/2020 (ΦΕΚ 254/τ.Α’/21-12-2020).
Οι παραπάνω διατάξεις, καθορίζουν αναλυτικά τα καθήκοντα, τις αρμοδιότητες και τις υποχρεώσεις των στελεχών (Διευθυντής, Υποδιευθυντής, Υπεύθυνοι Τομέων Εργαστηρίων και Υπεύθυνοι Εργαστηρίων Κατεύθυνσης), των εκπαιδευτικών του ΕΚ και των συλλογικών οργάνων του, τις διαδικασίες αντιμετώπισης παραπτωμάτων μαθητών, τη διεξαγωγή εκπαιδευτικών προγραμμάτων και εκδηλώσεων, καθώς και θέματα ασφάλειας και υγιεινής στους εργαστηριακούς χώρους.
Το ωράριο των Υπευθύνων Εργαστηρίων Κατεύθυνσης καθορίζεται από τη παράγραφο 14Α του άρθρου 66 του νόμου 4386 (ΦΕΚ 83/τ.Α’/11-5-2016).